Zu Beginn des 17. Jahrhunderts wurde sie von der Familie Esteva übernommen, die sie über sieben Generationen führte, bis sie 1926 vom letzten Apotheker geschlossen wurde. Im Jahr 1965 wurde sie von der Provinzialregierung von Girona erworben, mit der Zusage, sie in Llívia zu belassen.

Das Museum beherbergt auch eine bedeutende Sammlung archäologischer Fundstücke zur Geschichte des Ortes.